Tomsk gilt als die Universitätshauptstadt Sibiriens. Die Tomsker Staatliche Universität wurde 1878 gegründet und war die erste auf dem großen Territorium Russlands, östlich von der Wolga. Ihr schneeweißes Gebäude entwarf der Petersburger Architekt Bruni. Die bekannten, russischen Unternehmer Demidow, Sabaschnikow, Kaufleute aus Sibirien und Moskau, spendeten dafür das Geld.
Ursprünglich hatte die Tomsker Universität nur eine Fakultät, für Medizin. Jetzt gibt es 23 Fakultäten. Hier befindet sich auch das Museum für Zimelien. Und die wissenschaftliche Bibliothek bewahrt 4 Millionen Bücher auf! Gerade in der Tomsker Universität begann 2007 der stärkste in Osteuropa, Supercomputer SKIF Cyberia zu laufen.Die ersten Universitätsgebäude baute man nicht weit vom Tom-Ufer, inmitten eines Hains, der jetzt der Universitätshain genannt wird. Hier wurde der erste botanische Universitätsgarten in Sibirien angelegt. Der Hain selbst ist von einem alten Urwald übrig geblieben. Ende des XIX. Jahrhunderts jagte man hier die Eichhörnchen. Auch heute leben im Hain Eichhörnchen, Eulen und andere Vögel und Tiere. Der Hain ist auch mit ein paar steinernen «Weibern», Denkmälern für alttürkische Häuptlinge, geschmückt. Seit vielen Jahren «bewachen» die «Weiber» die Tomsker Universität. Und im ersten, historischen Universitätsgebäude befinden sich das zoologische und das paläontologische Museen.