Die Alexander-Newski-Kathedrale wurde mit Geldern der Stadtbewohner und des Imperators Nikolaus II, der mehr als 11 Tausend Rubel für den Bau und die Errichtung der Ikonostase opferte, gebaut. Er übergab der Kathedrale auch mehrere Ikonen von Athos.
Die Errichtung der Kathedrale im Namen von Alexander-Newski begann im Jahr 1897. Eines der ersten Steingebäude in Nowosibirsk erinnerte äußerlich an byzantinische Kirchen und die Petersburger Kathedrale der barmherzigen Gottesmutter. Italienische Experten waren für die Ziegelmauerung zuständig, den Boden beschloss man mit holländischen Fliesen zu belegen und für die Bemalung der Wände wurden Künstler der ersten sibirischen Ikonenmalerwerkstatt aus Tomsk beauftragt. Im Jahr 1938 wurde die Kathedrale geschlossen. Es war geplant die Kathedrale zu sprengen, doch im Endergebnis wurde nur der Glockenturm beschädigt. Die Kathedrale wurde zuerst dem Institut, später der Armee und danach einem Studio der Filmchronik übergeben. Im Jahr 1989 wurde die Kathedrale wieder an die Kirche zurückgegeben.