Die Kirche St. Michael, die zu Beginn des 16. Jahrhunderts errichtet wurde, ist in ganz Deutschland bekannt. Von 1524 bis 1529 hielt hier Martin Luther Predigten. Diese Lutherische Kirche ist eine der Schreine des Luthertums. Hunderte Bürger kamen hierher, um die Predigten des berühmten Reformators zu hören. Nun ist als Andenken an Martin Luther in der Haupthalle der Kirche ein Bronzegrabstein errichtet worden. Aber dies ist nicht das Grab von Luther, dessen Asche in Wittenberg ruht. Diese Gedenktafel wurde vom großen Künstler Lucas Cranach dem Älteren errichtet, der die Lehren Luthers von ganzer Seele akzeptierte.
Die Kirche hatte einen Turm mit einer Aussichtsplattform, den man hinaufsteigen kann. Von 80 Metern Höhe ist das historische Zentrum von Jena gut sichtbar. Von großem Interesse ist auch sein unterirdischer Eingang. Er wurde im 16. Jahrhundert ausgegraben, um die Kirche St. Michael und das ehemalige Zisterzienserkloster zu verbinden.